公司进行零申报时，需要填写的表格取决于公司的纳税人类型（如小规模纳税人或一般纳税人）以及当地的税务规定。
1.对于小规模纳税人，通常需要填写纳税申报表，并附上资产负债表和利润表。这些表格上需要盖上公司公章，然后将纳税申报表和资产负债表、利润表交给税务大厅和专管员。如果是通过网络进行零申报，可以通过电子税务局登录，填写并提交相关的纳税申报表。
2.对于一般纳税人，零申报时也需要填写纳税申报表，同时要填写资产负债表和利润表。此外，可能还需要填写销项税和进项税的相关表格。销项税是基于公司账上的记录，而进项税则是根据税务认证的税额来填写。在电子申报的情况下，主表数据通常是自动生成的，但有些数据仍需手动填写，如本月缴纳的上期税额。
无论公司规模大小，都必须确保所有提交的财务报表和税务申报都是基于实际发生的经济业务事项，并且不得包含虚假信息。