自然人独资公司法人变更需准备相关材料，包括营业执照副本复印件、税务登记证正副本原件、法人身份证原件及复印件、公司新章程原件及复印件等，并填写《税务登记证变更表》。完成准备后，向公司注册地的工商行政管理部门提交申请。工商部门将审核材料，并可能组织现场调查。审核通过后，会签发新的营业执照，并公告变更信息。企业在领取新营业执照后，还需到税务部门办理变更手续。整个过程中，需确保材料真实准确，配合工商部门调查，及时通知相关部门，以维护企业正常运营。