保安公司注册资质的办理流程主要包括：

1.提交申请：首先，向公安机关提出保安服务许可的申请，并提交相关材料，如公司章程、股东信息、注册资本证明、经营场所证明、管理人员和专业技术人员资格证明等。

2.审核过程：公安机关会对提交的申请材料进行审核，包括材料的真实性、完整性及是否符合法定条件。同时，还可能会对经营场所进行现场考察，以确保其符合保安服务的要求。

3.领取许可证：经审核通过后，公安机关将颁发《保安服务许可证》。这是保安公司合法开展保安服务业务的必要凭证。

整个流程中，保安公司需确保所有提交的材料真实有效，并符合相关法律法规的要求。同时，在获得许可证后，还需及时完成其他相关手续，如工商注册登记、税务登记等，以确保公司合法、规范地运营。