增值税进项税额加计抵减会计处理主要有三种方法。首先，可以通过冲减成本或费用的方式进行，即将加计抵减进项税视同为成本或费用的一部分，进行冲减。其次，可以将加计抵减进项税确认为营业外收入或其他收益，从而计入减免所得税的收入中。最后，可以通过“其他应收款”或“待抵扣进项税额”科目进行过渡，将加计抵减进项税暂存，并在满足条件时转入应纳税所得额中进行抵扣。以上三种方法均可根据企业实际情况选择使用，以确保税务处理的准确性和合规性。