土地使用税按照纳税人实际占用的土地面积为计税依据进行缴纳。具体面积确认依据如下：

1.若持有土地使用权证，则以证书记载的土地面积为准。
2.若尚未取得土地使用权证书，但持有其他土地使用证明材料（如《建设用地规划许可证》或土地权属文件），则以其上载明的土地面积为准。
3.若缺少土地权属、面积资料，则由纳税人自行申报，并经主管地方税务机关核定的土地面积为准。

若占用的土地已核发土地使用证，则按照土地使用证确认的占地面积计算征收；若尚未核发土地使用证，则按照实际占用的土地面积或税务机关核实的占地面积计算征收。

此外，土地使用税的具体税额标准根据土地所在地区（大城市、中等城市、小城市、县城、建制镇、工矿区）的不同而有所差异。如大城市每平方米年税额为1.5元至30元，中等城市为1.2元至24元等。