一张大额发票一次抵扣不完时，企业可以采取以下措施：

1.分期抵扣：根据《中华人民共和国增值税暂行条例》及相关规定，企业可以在后续的纳税期间内继续抵扣该发票上的税额，直至全部抵扣完毕。这种方式允许企业根据自身的经营情况和纳税安排，灵活处理大额发票的抵扣问题。
2.留抵退税：对于进项税额未抵扣完的部分，如果符合条件，企业还可以申请留抵退税。具体条件和申请流程需依据当地税务部门的相关规定执行。留抵退税政策有助于减轻企业的资金压力，提高资金利用效率。

在处理大额发票抵扣问题时，企业应注意以下几点：

确保发票的真实性和合法性，避免使用虚假或伪造发票进行抵扣。
严格遵守税务部门的相关规定和操作流程，确保抵扣的合法性和合规性。
妥善保管发票和相关凭证，以便在税务检查和审计时提供必要的证据。

以上措施仅供参考，具体操作时还需结合企业的实际情况和当地税务部门的具体要求。如有需要，建议咨询专业税务顾问或当地税务部门。