公司股权转让办理流程主要包括以下步骤：

1.召开公司股东会议，讨论并同意股权转让事宜，形成股东会决议。
2.聘请律师进行尽职调查，了解目标公司状况，规避潜在风险。
3.出让和受让双方进行实质性协商和谈判，确定股权转让的具体细节。
4.签订股权转让协议，明确双方权利和义务，包括股权转让价格、支付方式、交接时间等。
5.修改公司章程，记录股权变更情况，确保公司运营符合法律要求。
6.到工商局办理变更登记手续，提交相关文件，如股权转让协议、股东会决议等。
7.领取新的营业执照，完成股权变更登记，确保股权转让的合法性和有效性。

在整个过程中，应确保所有步骤均符合相关法律法规要求，以保障各方权益。如有需要，可咨询专业律师或机构协助办理。