公司整体转让主要涉及的税种包括增值税、企业所得税、印花税和契税。增值税根据转让金额，按照一定税率计算缴纳，税率通常在3%至5%之间。企业所得税则需要对转让收益进行纳税调整，并按照企业所得税税率计算缴纳。印花税根据转让合同金额，按照一定比例计算缴纳。此外，如果转让过程中涉及土地使用权、房屋所有权的转移，还需要缴纳契税。在整体转让过程中，应仔细计算并缴纳相应税款，同时遵守相关法律法规和政策规定，确保税费计算的准确性和合法性。