公司变更法人的费用因法人是否持有公司股份而有所不同。若法人不占公司股份，变更费用通常较低，可能在几百元至数千元之间，具体取决于行政手续和代理服务等费用。然而，若法人占有公司股份，变更过程将涉及股权转让，此时除了基本的行政费用外，还需缴纳印花税和个人所得税。印花税按注册资金的万分之五收取，个人所得税则根据股权转让的方式（平转或差额转）不同，费用分别为注册资金的万分之五或万分之二十。因此，公司变更法人的总费用会因具体情况而有所差异。