网络经营许可证应由从事经营性互联网信息服务的公司向当地电信管理机构或国务院信息产业主管部门申请。这些部门在收到申请后，会进行审查，并在60日内决定是否批准。如果批准，将颁发经营许可证。申请流程一般包括自审公司申请条件、书写申请材料、提交所在省通信管理局审批及审批通过领取证书。申请人还需在取得经营许可证后，向企业登记机关办理登记手续。