企业增值税和企业所得税在税种性质和征税对象上存在显著差异。企业增值税是对商品生产、流通、劳务服务等环节的新增价值或商品的附加值征收的流转税，以商品在流转过程中产生的增值额为计税依据。而企业所得税则是对我国境内的企业和其他取得收入的组织的生产经营所得和其他所得征收的税，其计税依据是企业的应纳税所得额，即收入总额扣除各项成本、费用、税金、损失等支出后的净所得额。两者在税种性质上分别为流转税和所得税，在征税对象上也存在明显区别。