农业公司需要根据国家税法规定缴纳相关税费，主要包括以下几个方面：
1.增值税：对于农产品销售，一般适用较低的增值税税率或者免税政策。
2.企业所得税：农业公司需按其盈利情况缴纳企业所得税，符合条件的企业可能享受减免优惠。
3.印花税：涉及合同签订时需缴纳的税费。
4.房产税和土地使用税：如果公司拥有房产或土地使用权，则需按规定缴纳相应的税费。
5.城市维护建设税和教育费附加：基于增值税基础上计算缴纳的税费。
农业公司可以根据国家和地方政策享受一定的税收优惠，例如对于从事种植业、养殖业的企业，可能享受减征或免征企业所得税等优惠政策。