在深圳申请营业执照时，可以通过以下方式进行线上申请：
1.通过微信或支付宝中的“电子营业执照”小程序，或下载“电子营业执照”App来下载电子营业执照。
2.法定代表人需要先进行实名认证，然后选择企业所在的登记地，下载企业的电子营业执照。
3.关注“深圳市场监管”微信公众号，点击“政务服务”菜单，选择“行政许可”，然后进入网上政务大厅页面，选择“商事登记电子化(全流程)”，最后点击“电子营业执照发放”进行申报。
4.登录深圳市市场监督管理局网站，通过商事主体登记注册的办理入口进行申请。
5.填写相关资料，包括企业名称、统一社会信用代码、法定代表人姓名、电子营业执照等，并上传必要的申请材料。
6.完成电子签名，提交申请。系统将自动审核并生成电子营业执照。
7.审核通过后，可以选择线上或线下领取电子营业执照。
请注意，具体的操作流程可能会根据实际情况有所变化，建议详细阅读每个步骤的指引并遵循操作。