小规模公司在进行零申报时，可以通过以下步骤进行：
1.登录税务局。小规模公司需要进行零申报时，首先需要登录税务局的网站，这通常涉及到使用企业的纳税人识别号和密码。
2.填写申报表。登录后，需要填写纳税申报表，对于零申报，这些表格通常需要全部填为零。小规模纳税人通常需要填写主表和副表，而这些表格上的本期数都应是零，因为企业没有经营活动。
3.提交申报。完成表格后，就可以提交申报。如果企业使用电子税务局服务，可以直接在线提交。对于一些地区，可能还需要打印并盖章后亲自交给税务大厅或专管员。
4.确认申报结果。提交后，系统会显示已受理，企业可以等待反馈的申报结果，或者点击返回，待下次登录后收取结果。
此外，对于一些地区的小规模公司，可能还需要进行个人所得税的按月申报，以及印花税、企业所得税等按季度申报。