分公司转让税务处理流程包括：1.前期准备：了解税务政策，详细掌握公司财务情况，确认转让方案及价格、款项支付、税费承担等细节。2.税务清算：确认税务责任归属，处理欠税、滞纳金等，确保税务清算完毕。3.税务申报：进行税务登记更新，提交纳税申报表，并按时缴纳税款。4.后续工作：结清转让款项，及时备案，并定期进行税务汇报。处理过程中需确保合法性和完整性，咨询税务专员并遵守当地税务部门规定。