分公司转让收入的入账处理需依据分公司核算方式。若分公司独立核算，则收入先计入分公司账目，再通过内部往来账户转至总公司；非独立核算则直接计入总公司账目。入账时需明确收入来源，区分股权与资产转让，并遵循会计准则。需设置“其他应收款”等科目核算转让款，可能涉及“营业外收入”等科目。同时，需关注税务处理，确保税费合规缴纳。建议企业咨询专业会计师以确保账务处理的准确性和合规性。