代理公司转让税费的计算，主要涉及企业所得税、印花税等。企业所得税一般按转让收益的25%计算，但具体税率可能因政策调整而变化。印花税则根据转让合同的金额，按一定比例缴纳，具体比例可查询最新税法规定。此外，若转让涉及不动产，还需缴纳土地增值税、契税等。代理转让公司会根据公司实际情况进行估值，并协助完成税费的计算和缴纳。需注意，税费计算需遵循相关法律法规，建议及时咨询税务专业人士。