代理公司转让税费缴纳涉及多个税种，主要包括印花税、所得税等。印花税按产权转移书据的万分之五交贴，上市公司交易则按千分之一缴纳。所得税方面，个人转让需缴纳20%的个人所得税，企业转让则并入当年应纳税所得额计缴企业所得税。此外，还可能涉及契税等税种，具体需根据当地税务规定确定。代理公司转让时，应咨询专业税务机构或税务部门，确保税费正确缴纳。