代理公司转让费用计算复杂，涉及多方面因素。主要包括转让价款、税费、评估费、律师费、顾问费、手续费等。转让价款通过评估或市场价格确定；税费根据税法规定计算，如所得税、增值税等；评估费由专业机构收取，根据公司规模和复杂性而定；律师费和顾问费用于法律文件和咨询；手续费包括公证、登记、审批等费用。具体费用需根据实际情况和双方协商确定，建议咨询专业机构以获取准确报价。